北京核工業醫院現有北京西城、北京房山及天津三個院區，是一所集醫療、預防保健、職業病防護、核素治療和核應急為一體的綜合性醫院。

　　西城院區位于北京西城區三里河，一級甲等醫院，以職業病體檢、健康保健、康復醫療為特色，具有北京市衛生局批準的首批健康體檢從業資質。院區開放床位45張，現有職工100多人，設有內科、外科、全科病房、婦科、中醫科、口腔科、耳鼻喉科、眼科、康復科、放射科、彩超室、鉬靶室、檢驗科、電子胃鏡室、心電圖室、健康管理部、體檢中心等科室。

　　房山院區（原中國核工業北京四○一醫院）是一家二級綜合性醫療機構，承擔著原子能院核輻射事故醫學應急后援任務。院區開設病床280張，現有職工410人，開設臨床、醫技等20多個科室，其中核素治療中心、口腔科、眼科三個專業是房山區衛生系統專業委員會主任委員單位，核素治療中心是中華醫學會核素治療示范單位、首都醫科大學核醫學專業教學基地。

　　天津院區（核工業理化工程研究院原職工醫院）位于天津市河東區，現有職工10余人，主要承擔核理化院職工健康體檢、醫療應急保障和防疫等職能，并對核理化院職工家屬及周邊居民提供基本門診醫療服務。

　　醫院官方網站：http://www.cnncbhy.com/